חלקים מדו"ח מבקר המדינה על התנהלות בכירים במהלך מבצע 'צוק איתן' הגיעו לידי כתבים בתקשורת. על פי ההדלפות, מדובר בדוח חמור מאוד שמותח ביקורת קשה על התנהלות הבכירים במהלך המבצע – בעיקר על התנהלותו של הרמטכ"ל דאז, בני גנץ, אך גם שר הביטחון וראש הממשלה סופגים בו ביקורת רבה. בין היתר, מוזכרים כי נתניהו ויעלון הסתירו מהקבינט המדיני-ביטחוני את העובדה שבשב"כ התריעו על עימות מול חמאס ביולי 2014. את ההתרעה הזו גילו השרים רק במהלך המבצע. בסביבת ראש הממשלה ושר הביטחון טוענים כי הם דוחים את הטענות שעולות מן הדוח ושהטיוטה שהודלפה רצופה באי דיוקים.
בסביבתו של שר הביטחון דחו את הטענות העולות מטיוטת הדוח כפי שפורסמו וכינו אותה "שערורייתית". לדבריהם, "העובדות בטיוטה אינן מדויקות, ומי שכתב אותה אינו מבין מהי מערכת קבלת החלטות וכיצד פועל קבינט. בעניין המנהרות, גם כאן הדוח פשוט מנותק מהמציאות. מדינת ישראל מתעסקת עם נושא המנהרות ומקדישה לו משאבים ניכרים כבר שנים ארוכות. המערכות השונות קיימו על כך אינספור דיונים בכל הפורומים הרלוונטיים, כולל בקבינט. מי שטוען שלא הכיר את האיום ואת ההתעסקות בו פשוט משקר את הציבור. כל מי שנגע בעניין הבין את חומרת האיום, וכל ניסיון לתאר זאת באופן אחר הוא שרלטני. טיוטת הדו"ח רצופה באי דיוקים, בלשון המעטה, ולוקה בחוסר הבנה ברור של הפעילות ושל המערכת".
גורמים בסביבת ראש הממשלה מסרו בתגובה כי "זה דו״ח לא רציני של גוף לא רציני. אנו דוחים את הדברים על הסף אם הם יופיעו כך בדוח הסופי. הדברים שפורסמו כוללים טעויות עובדתיות. חודשים ארוכים לפני המבצע היו דיונים ספציפיים בקבינט על נושא המנהרות שעסקו גם בקידום פתרון טכנולוגי. מעבר לכך, המערכה נוהלה היטב ובשקיפות חסרת תקדים עם שורה של דיוני קבינט אחת ליומיים. הדוח מדיף ריח פוליטי והוא נתמך על ידי חברי קבינט לשעבר שהיום נמצאים באופוזיציה ורוצים לנגח את הממשלה".
האזינו לראיון שקיימנו בנושא עם יו"ר ישראל ביתנו וח"כ אביגדור ליבר